科属不同：防风属于伞形科、防风属、防风种，防己属于防己科、千金藤属、防己种。
外观不同：防风的根茎较粗壮，形状为圆柱形，颜色为淡黄棕色，茎单生，基部分枝较多，基生叶丛生，防己本身属于粉防己植株的干燥根茎，形状呈圆柱状，肉质，外皮为淡棕色，具有横纹。
产地不同：防风主产地为河北、宁夏、甘肃等省份，防己主产地为广东、广西等省份。
一、科属不同
1、防风：属于伞形目、伞形科、脂胶芹族、防风属、防风种。
2、防己：属于毛茛目、防己科、千金藤属、防己种。
二、外观不同
1、防风：茎单生，基部的分枝较多，大约与主茎等长，基生叶丛生，有扁长的叶柄，基部有宽叶鞘，叶片呈卵形，根茎呈圆柱形，较粗壮，颜色多为淡黄棕色。
2、防己：植株为多年生落叶藤本植物，本身属于粉防己植株的干燥根茎，形状一般为圆柱状，呈肉质，外皮一般为淡棕色或棕褐色，具有横纹。
三、产地不同
1、防风：主产于河北、宁夏、甘肃、辽宁、内蒙古、山西、山东、陕西、黑龙江、吉林等省区，一般长在草原、丘陵、多砾石的山坡上面。
2、防己：主产于湖南、广东、广西等省份。
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