1、水霉病
水霉病水霉病是由水霉菌、绵霉菌等真菌引起的，它常常出现于淡水鱼类中，真菌常年潜伏于水体中，找准时机侵害甲鱼，一旦侵入，病菌会吸取营养开始生长，几天内即可覆盖甲鱼全身，造成甲鱼行动缓慢、食欲减弱、直至体弱而死亡。发病初期，菌丝还为生长，所以看不出什么异常情况，随着菌丝生长，甲鱼外表出现灰白色棉絮状菌丝，在水中看时呈絮状，层层浓密。
防治方法：加强水质管理，防止因水体污染，导致病菌滋生，定期消毒霉菌，在饲料中添加维生素E可增加鳖体的抗霉菌能力。发现病害后将甲鱼放置在稀释盐水或小苏打溶液中药浴12小时即可治愈。
2、红脖病
红脖病又叫大脖子病，它是由嗜水气单胞菌引发的，和水霉病一样，嗜水气单胞菌在水体滋生，由于各种因素原因侵入甲鱼身体中，引发病害。发病时甲鱼的脖子红肿、充血，有些甲鱼还出现全身性水肿现象，腹部有红色病斑，病斑逐渐扩散病溃烂。使甲鱼对于外界的敏感性降低、食欲减弱、行动缓慢，都潜伏于阴凉处，很多在上岸后最终晒死。
防治方法：此病都发生在高温季节，以预防为主，在饲养时每周对甲鱼投喂几次抗病毒药剂，再在暴雨前后兑水体消毒，避免病害发生。发病时，及时兑水体消毒，然后换水，再在饲料中拌清热通投喂，连续三天后，即可抑制或治疗好。
3、腐皮病
腐皮病也是有病菌侵入感染而致，它主要通过甲鱼相互搏斗咬伤后或其他原因导致体表有伤口侵入感染。它的发病率高，流行时间长，发病时，体表皮肤开始发炎、肿胀，病变组织开始逐渐坏死变色，紧接开始溃烂。随着病情扩散，溃烂面积越来越大，严重者可肌肉与骨骼裸露、四肢烂掉，爪脱落，危害极大。
防治方法：放甲鱼入池时要健康、无伤口的，保持水质清洁，定期消毒，在饲料中添加维生素E，增加抗病力。发病时，将池水排空，然后将甲鱼全部捞出，先用石灰水对养殖池塘消毒，暴晒后再放水入池，甲鱼用稀释的高锰酸钾溶液浸洗，再用漂白粉涂抹，连续几天即可痊愈。
