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巴西龟在幼龟时期，很多的外观特性都是比较相似的，不能够单纯的从外观图案、花纹等来区分公母，要根据其龟甲、尾巴、泄殖孔等来分辨。而成年龟就比较容易判断了，可以根据外观、生理特点等分辨。但是幼龟的公母的分辨方法也是照样适用于成年龟的，另外，还可以从体重、花纹、身体颜色等来区分。
1、看外形
公巴西龟的体型稍微大点，公巴西龟的背甲是比较长而窄的，腹甲中间是稍微向内凹陷的。母巴西龟的背甲是比较短而宽的，腹甲中间是平坦没有凹陷的。
2、看尾巴
公巴西龟的尾巴较长，尾巴基部较粗的为公的，母巴西龟的尾巴短，尾基部很细的则为母的。
3、看指甲
一般认为，公的巴西龟的指甲相比母巴西龟，要长一些。
3、看泄殖孔
泄殖孔指的是巴西龟的排泄孔到腹甲后端之间的距离。母的排泄孔离腹甲后端的距离就更短，也更近，而公的排泄孔离腹甲后端的距离则更远更长。
4、看体重、颜色和花纹
通常来说成年的母龟，它的体重一般不会超过1斤，并且它的腹部花纹也是比较稀疏的，背甲的颜色为黑色。而公龟的体重一般在2-4斤之间，腹部的花纹比较密集，颜色也为以前的体色或褐色。
5、看生殖器
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