多菌灵：具有保护和内吸的作用，能够和细胞核中的微管蛋白亚基结合形成复合体，从而阻碍纺锤丝正常形成，抑制细胞有丝分裂，最终起到灭杀病菌的作用。
百菌清：是一种保护性杀菌剂，无内吸作用，能够和细胞中的三磷酸甘油醛脱氢酶发生反应，并与该酶中含半胱氨酸的蛋白质结合，使得该酶失去活性，从而破坏细胞新陈代谢，最终达到灭杀病菌的作用。
一、作用机理
1、多菌灵属于苯并咪唑类杀菌剂，能够与细胞核中的微管蛋白的亚基结合形成复合体，从而阻碍细胞分裂过程中纺锤丝的正常形成，抑制细胞有丝分裂，最终达到灭杀病菌的目的。
2、百菌清能够与真菌细胞中的三磷酸甘油醛脱氢酶发生反应，并与该酶中含有半胱氨酸的蛋白质结合，从而使得三磷酸甘油醛脱氢酶失去活性，让真菌细胞的新陈代谢遭受破坏，从而达到灭杀病菌的目的。
二、作用方式
多菌灵是一种内吸性杀菌剂，具有保护和内吸的作用，而百菌清是一种保护性杀菌剂，没有内吸传导作用。
三、杀菌范围
1、多菌灵对于半知菌亚门、子囊菌亚门、担子菌亚门等病菌引起的病害有较好的防治效果，但是对于卵菌、链格孢菌、长蠕孢菌以及细菌无效。
2、百菌清对于半知菌亚门、鞭毛菌亚门等病菌引起的病害有较好的防治效果。
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