科属不同：草菇属于光柄菇科、草菇种，香菇属于光茸菌科、香菇种。
外观不同：草菇的菌盖展开前呈钟形，展开后呈伞形，最后呈碟状，菌盖中央颜色较深，四周渐浅。香菇的菌盖呈扁平状，颜色多为浅褐色、深褐色，中部有深色的鳞片，边缘有絮状鳞片，菌肉质厚，色白。
生长环境不同：草菇的培养基多为稻草，香菇的培养基多为段木。
一、科属不同
1、草菇：属于伞菌目、光柄菇科、小包脚菇属、草菇种。
2、香菇：属于伞菌目、光茸菌科、香菇属、香菇种。
二、外观不同
1、草菇：菌丝无色透明，子实体由菌盖、菌柄、菌褶、外膜、菌托等部分构成，其菌盖展开前呈钟形，展开后呈伞形，最后呈碟状，菌盖中央的颜色较深，四周渐浅。
2、香菇：菌盖扁平或稍扁平，表面为浅褐色、深褐色至深肉桂色，中部往往有深色的鳞片，而边缘常有污白色的毛状或絮状鳞片，菌肉的颜色为白色，肉质稍厚，味香。
三、生长环境不同
1、草菇：常见于野外的草堆上，人工种植时通常将稻草作为培养基。
2、香菇：常见于野外的树木上，人工种植时通常将段木作为培养基。
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