合理轮作或间作：可有效防治病虫害，且能使土壤肥力被充分利用。耕作深耕：可促进植物根系生长发育，增强植物的抗病能力。除草及修剪：将病虫残体和落叶枯枝，用火烧毁或者进行深埋可有效减少第二年病虫害发生率。合理施肥：可提高植株抵抗力，来减少病虫害发生。选择品种：选择抗虫害能力强的优质品种。
一、合理轮作、间作
进行合理的轮作、间作，不仅能防治病虫害，还能使土壤肥力充分利用，种过参的地块在短时间内不能再进行种植，否则病害会非常严重，会导致作物大量死亡，轮作时间长短可根据病原生物在土壤内存活的时间而定。
比如白术的根腐病，还有地黄枯萎病轮作时间均为3-5年，因此合理的选择轮作物也很关键，一般同科属植物，或者同为某些严重病虫寄主的植物，不宜选择为下茬作物，间作物的选择和轮作物的选择相同。
二、耕作深耕
耕作深耕不仅能促进植物根系的生长发育，还能增强植物的抗病能力，并且能破坏蛰伏在土中休眠的害虫巢穴与病菌过冬的场所，可直接消除害虫和病原生物，种植时可翻耕晾晒几次，有利于改善土壤物理性状，减少土壤内致病菌的数量。
三、除草、修剪
种植过程中要及时清除田间杂草，药用植物采收后，受病虫危害的残留体，还有掉落在田间的落叶枯枝，一般是病虫隐蔽与越冬的主要场所，是第2年病虫的来源途径，因此需要除草清理田园，并结合修剪将病虫残体和落叶枯枝，用火烧毁或者进行深埋，可以减少第2年病虫害的发生率。
四、调节播种期
多数病虫害是与种植药用植物的某个发育阶段物候期密切相关，如果能使生长发育阶段错过病虫大量传播为害的危险期，就能够避开病虫害，也可达到防治病虫害的目的。
五、合理施肥
合理施肥能够促进药用植物生长发育，并且提高抵抗力，比如种植白术施足有机肥后，还可适当增施磷、钾肥，有利于减轻花叶病，但使用的厩肥、堆肥，一定要充分腐熟，否则会导致肥料中的残存病菌，还有地下害虫蛴螬等虫卵未被杀除，容易使地下害虫与多数病害加重。
六、种植优质品种
有刺型红花要比无刺型红花，更能抗炭疽病、红花实蝇，一般白术矮秆型可抗术籽虫等，因此可挑选一些抗病虫害能力强的品种进行种植，有利于作物的健壮生长。
